Program Studi Agroteknologi didirikan berdasarkan SK 179/MPN/KL/2004 pada tanggal 10 Desember 2004, pada tahun 2006 mengawali proses kegiatannya dengan penerimaan mahasiswa angkatan pertama (Tahun Akademik 2006/2007). Pada awal berdirinya program studi Agroteknologi bernama Program Studi Pertanian, seiring dengan adanya perubahan nomenklatur program studi Pertanian berganti nama menjadi Program Studi Agroteknologi.
